即以荷方引证的天启四年（1624）八月二十日厦门地方长官何某（可能是泉州府海防同知何舜龄），给荷方头目宋克（maartensonk，后来被委为所谓第一任荷兰的台湾长官）的复信而言，措辞是：

“本函作为阁下要求事项之答复。据报你们已放弃澎湖城砦，该地已恢复原貌，足见你们已忠实执行协定。

因此我们深信你们的友好诚意。

现在总督大人已获悉荷兰人远道而来，要求在赤道以南的巴达维亚及我方的***岛之间与我方贸易。

因此，我们决定前往福州报告巡抚及衙门，以便以友好关系与你们相处。

现在通商之事既已对阁下有了充分保证，你方船队司令可前往巴达维亚向你方长官报告一切。”

这里，台湾被称为***岛不符合中国习惯，但“我方的***岛”却是明确无误的。

明政府收复澎湖之后，福建沿海恢复了平静。

但这种局面并没有维持多久，具有海盗性质的郑芝龙势力逐渐扩展，

他们是海盗，同时也是一股主要从事海外贸易的中国商人，有时为了取得粮食、淡水和其他物资，时不时的对福建沿海地区进行掠夺。

1628年（崇祯元年）郑芝龙接受大明的招抚，从此，他利用官方身分扫除其他“海贼”，既可以向朝廷报功，又增强了自己对海外贸易的垄断地位。

史料表明，他同荷兰殖民者在利益上有勾结，也有矛盾。

1633年（崇祯六年）在明朝福建当局的坚持下，郑芝龙不得不配合其他明军在福建近海数次大败荷兰殖民者为主的海盗武装，但未暇顾及台湾、澎湖。