2005年，阿巴斯上台后，巴以关系明显改善。2月8日，在穆巴拉克的倡议和推动下，以、巴、埃、约领导人在埃及沙姆沙伊赫举行峰会，就巴以停止长达4年多的暴力冲突达成协议。此后，以暂停了对巴军事行动，先后释放了898名在押巴囚，并向巴移交了杰里科和图勒凯尔姆两城的安全控制权。8月15日到9月20日，在埃及等方面的推动以及巴方的积极配合下，以完成从加沙和约旦河西岸部分地区撤离犹太定居点和军队的“脱离计划”。11月15日，在美国斡旋下，以同意开放加沙与埃及交界处的拉法口岸以及加沙南部与以交界处的凯雷姆货物口岸，同意巴修建加沙港口，并允诺逐步开放加沙地带农产品向以出口的通道等。25日，由巴控制、欧盟观察员监督的拉法口岸正式开放。

但是，双方的暴力冲突仍时有发生。2005年7月12日，以海滨城市内坦亚遭巴武装人员自杀式爆炸袭击。以随即宣布恢复“定点清除”，一度平静的巴以局势再度紧张，原定的巴以第三次首脑会晤被迫取消。12月5日，内坦亚再次遭袭，以宣称将继续采用“一切可能的方式”来制止巴武装人员的袭击。28日，以启动“蓝天”军事行动，意图在加沙北部建立军事隔离区，阻止巴武装人员袭击以城市。

2006年哈马斯组阁后，以要求其接受“三项条件”，并对巴进行政治孤立和经济封锁。6月25日，巴武装人员袭击以军哨所，造成数名以军伤亡，并绑架了一名以军士兵。以军随后对巴展开大规模军事行动，逮捕60多名巴部长、立法委员。11月，巴以宣布在加沙停火。12月，以总理奥尔默特与阿巴斯会晤。2007年3月，巴民族联合政府成立后，以对其采取“不承认、不交往”政策，维持对巴封锁，但与阿巴斯保持接触。

同美国的关系

美国曾长期拒不承认巴解。1988年12月，巴美开始对话。海湾危机爆发后，巴解一再抨击美在处理海湾危机问题和巴勒斯坦问题上实行“双重标准”，要求美以同样的标准执行联合国和安理会关于解决巴勒斯坦问题的决议。美则指责巴支持伊拉克。海湾战争结束后，美推行中东和谈计划，巴解对此采取积极立场，巴、美关系渐趋缓和。1993年9月，经美撮合，巴以签署华盛顿原则宣言，实现相互承认，美随后宣布承认巴解为巴人民的代表。1994年6月24日，美将巴驻美办事处升格为官方使团，并利用美驻耶路撒冷总领馆与巴进行联系。1998年12月，克林顿访巴，这是美总统第一次访问巴自治区。阿拉法特执政后期，美巴关系紧张，美拒绝同阿接触。2005年阿巴斯上台后，美巴关系改善。2006年哈马斯胜选并组阁后，美反应强烈，表示不会与巴政府进行接触，要求国际社会孤立哈马斯，直至其改变立场、接受“三项条件”，并停止了对巴直接援助。2006年下半年以来，美国务卿赖斯多次访问巴以。10月，阿巴斯访美，会见美总统布什。布什称阿巴斯是有远见且爱好和平的领导人。2007年巴民族联合政府成立后，美表示将密切关注巴政府实际行动，并与新任巴财长接触。4月，美国会批准向阿巴斯领导的安全部队提供5900万美元资金。