1438年至1527年间，印加帝国从首都库斯科开始扩张。它控制了现在安第斯玻利维亚的大部分地区，并将其控制扩展到亚马逊盆地的边缘。

殖民时期

西班牙对印加帝国的征服始于1524年，到1533年基本完成。现在称为玻利维亚的领土被称为Charcas ，在利马总督的管辖下。地方政府来自位于Chuquisaca （拉普拉塔——现代苏克雷）。波托西( Potosí)成立于1545年，最初是一个矿业城镇，很快就产生了惊人的财富，成为新大陆最大的城市，人口超过15 万。

到16世纪后期，玻利维亚白银已成为西班牙帝国重要的财政收入来源。在西班牙版本的前哥伦布征兵制度称为mita的残酷奴隶条件下，源源不断的当地人充当劳动力。查卡斯1776年移交给拉普拉塔河总督辖区，总督辖区首府布宜诺斯艾利斯的人民创造了“上秘鲁”（西班牙语：Alto Perú）一词作为对查尔卡斯皇家观众席的普遍称呼。图帕克·卡塔里(Túpac Katari )领导了土著叛乱1781年3 月围攻拉巴斯，期间有20000人死亡。随着拿破仑战争期间西班牙王权的削弱，反对殖民统治的情绪高涨。

独立和随后的战争

独立斗争于1809年5月25日在苏克雷市开始，丘基萨卡革命（丘基萨卡当时是该城市的名称）被称为拉丁美洲自由的第一声呐喊。这场革命之后是7月16日的拉巴斯革命。拉巴斯革命标志着与西班牙政府的彻底分裂，而丘基萨卡革命则以被拿破仑·波拿巴废黜的西班牙国王的名义建立了地方独立军政府。两次革命都是短暂的，都被总督辖区的西班牙当局击败，但次年西班牙裔美国人的独立战争在整个大陆肆虐。

玻利维亚在战争中被保皇派和爱国者多次俘虏和夺回。布宜诺斯艾利斯派出3次军事行动，但都被击败，最终仅限于保卫萨尔塔的国界。玻利维亚最终被从保皇党统治下解放出来，安东尼奥·何塞·德·苏克雷 (Antonio José de Sucre)元帅发起了一场北方战役，以支持西蒙·玻利瓦尔( Simón Bolívar )的军事行动。经过16年的战争，共和国于1825年8 月6日宣告成立。