在1980年的马列尔偷渡事件中，有15万古巴人渡海北上。跟1960年代的那批不同的是，这批难民中的大多数都很贫穷。卡斯特罗政府默许了此次偷渡，并利用此事件清走了大量的罪犯和精神病人。另一场大规模的古巴移民潮发生在1994年，为了防止马列尔偷渡事件重演，克林顿政府宣布在海上被拦截的古巴人将不被带往美国，而是送至关塔那摩基地或巴拿马。在从1994年夏天开始八个月的时间里，有超过三万名古巴人和被拦截，并被送往美国本土之外的营地。

1994年9月9日，美国与古巴就移民问题达成协议：规定美国需将古巴难民安置在美国本土之外安全的避难所，古巴也承诺阻止其国民偷渡，自此美国每年接受两万名合法古巴移民。1995年5月2日，第二项协议达成，允许关塔那摩难民营里的古巴人进入美国。同时建立了一个直接遣返在海上被拦截的古巴人的制度，古巴政府承诺不对这些被遣返者进行惩处。

约1/3的古巴家庭在美国有亲戚，他们收到的汇款抵消了一小部分制裁带来的损失，但由于移民的种族构成，黑人家庭普遍在消费上处于一定的弱势。

科技

19世纪，古巴涌现了一些著名的科学家，如发现黄热病传染的病医学家卡洛斯·芬利（Carlos  Finlay， 1833～1915）、动物学家费利佩·波埃（Felipe Poey，1799～1891）等，在他们的努力下，古巴的科学达到了一定的水平。1861年5月19日成立了医学、物理学和自然科学院（La Academia de CienciasMédicas， Físicas y Naturales）。

古巴坚持走可持续发展的道路，注重保护和合理开发利用本国资源，关注气候变化和环境保护，强调发展生物技术、医药产品、软件工业、信息技术、基础和自然科学、可再生能源的开发和利用等。古巴科技发展的重点和优势领域是生物制药技术。

1962年，古巴成立了科学院。古巴科学院下设30多个研究所和研究中心。自1980年至1994年，科学院是古巴科技方面的领导机构，除古巴科学院外，古巴党中央、国务院、政府各部、大学、军队和一些大企业等也设立了一系列研究机构。1994年根据古巴国务委员会法令，由新成立的科学、技术和环境部（Ministerio de Ciencia，Tecnologia y Medio Ambiente，CITMA）取代科学院来领导全国的科技和环保工作，并领导全国原子能委员会。

全国成立了科学和技术创新体系（Sistema de Ciencia e InnovacionTecnologica），组成若干个专业阵线（frentes tematicos）和15个科技中心（poloscientificos），有12个是省级的科技中心，另外还有3个中心：哈瓦那西部科技中心、工业科技中心、人文科学研究中心。

古巴坚持走可持续发展的道路，注重保护和合理开发利用本国资源，关注气候变化和环境保护，强调发展生物技术、医药产品、软件工业、信息技术、基础和自然科学、可再生能源的开发和利用等。古巴科技发展的重点和优势领域是生物制药技术。