《四签名》中可以看出，他遇到玛丽·莫斯坦不早于1888年7月，但从《五颗橘核》中又可以看出华生在1887年9月处于结婚状态（妻子回家省亲）因而又和福尔摩斯住在一起，《波希米亚丑闻》也提到他在1888年3月处于婚姻中。且《军人归来斑面案》显示，玛丽去世后，华生约于1903年再婚。

抽烟：血字的研究中，华生向福尔摩斯作自我介绍时提到自己总是抽船牌烟。船牌烟的原文为ship‘s

华生是喜欢船员抽的烟呢，还是喜欢“船”牌烟呢？

这里存在歧义，导致了诸多争论。雪莱·吉恩在《船员还是船牌，只是个问题》一文中指出，《英语俚语词典》以及《士兵和船员俚语词典》都提到“ship‘s“意思是“船上抽的可可烟”。杰克·翠西在《福尔摩斯百科全书》中认为，这是指“船员烟店特供烟，这种烈性混合烟在诺桑伯兰制造，深受海员的喜爱“。威廉·巴林-古尔德认为华生在运兵船：“奥伦蒂兹号”上开始抽船牌烟。不过前文中提到华生的“健康已是糟糕透了，几乎达到难以恢复的地步”，似乎不可能抽烟。

爱德华兹认为华生是在开往印度的船上开始抽船牌烟的。而在《驼背人》中，福尔摩斯说华生还在“吸你婚前吸的那种阿卡迪亚混合烟”，可见不久之后华生就放弃抽船牌烟了。而这种“阿卡迪亚混合烟”则是一种虚构的烟草品种。