第九日天一亮日军便再度攻城，加藤军首先攻破晋州一角，加藤部下武士及伊达政宗率先从此缺口突入城中，大队日军蜂拥入城，晋州军民被迫转入巷战，迎来的自然是无尽屠杀。

金千隘携子金象乾和崔庆会、高从厚等人退至石楼，眼见大势已去，金千隘慷慨道：“能与诸位在此合力一战，保卫家国，此生无憾！然事已至此，恐再无回天之力，此处便是我辈葬身之地了。”

高从厚深觉悲愤，感慨言道：“我自感无能，深恨未能亲自斩下小早川隆景首级告慰父兄在天之灵。父兄之言言犹在耳，我高氏一门绝无贪生怕死之辈，好在苦战至今斩倭寇无数，想来也无愧列祖列宗，更未给义军丢脸。即便今日再无回天之力，我等身躯也绝不能落在倭寇手中，受死后羞辱！”

崔庆会亦感慨万千，道：“诸位忠心豪情令我感佩，如倡义使所言，此次得以一同并肩作战，虽死无憾。今日虽逢绝境，亦有与诸位义结金兰之愿！今日得以同死，来世再结伴杀敌报国！不知诸位意下如何？”

众人皆深受感动，想一饮诀别酒，却不料侍者却早已逃遁。眼见日军已追至楼下，崔庆会引领众人朝北跪拜，临死前结为兄弟，齐跳南江殉国。

金海府使李宗仁勇力超群，率部转战四门，渐遭围攻被逼至南江。李宗仁见死不可免，便突然袭击，将两名日兵夹在肋下，大喊道：“金海府使李宗仁死于此！”然后携裹日兵转身跳入南江。

另一将领金俊民纵马巷战，往来冲杀，终因寡不敌众被火绳枪射落马下，遭乱刀砍死。城墙已破，晋州军民难敌日军进攻，死于铁炮和刀下者不计其数，其余百姓为避屠刀，也只能选择葬身南江。

日军屠城半日，焚烧民宅，推平城墙，掩井伐木，晋州成一片废墟。而后日军当夜彻夜狂欢，再作休整后便分批开进全罗道各处，朝鲜各军没了晋州坚城，自然难以阻挡。

晋州沦陷后，宋应昌下令戚金急进兵陕川、吴惟忠进兵草溪布防。而日军军师黑田官兵卫也于釜山收到了来自丰臣秀吉的命令，调其回国问罪。

黑田官兵卫返回日本后连番请罪，并于七月剃发出家，号如水圆清，此是后话，暂且不提。

作为曾经获得大捷的坚城，晋州失陷的消息震动朝鲜，更多人意识到在没有明军直接参战的情况下，仅凭朝鲜军和义军等对抗日军着实千难万难。