但到了中年后，李自成攻陷北京，国破家亡，方以智从北京逃返南京，又从南京到浙江、福建，最后辗转到了两广，颠沛流离，思想也发生了极大的改变。

1646年，永历皇帝任命方以智为少詹事、翰林院侍讲学士，

但后来由于永历朝党派内斗严重、太监专权，令方以智心灰意冷，于是辞官隐居于湖南与广西交接处的苗峒中，

此后永历帝屡次召他为东阁大学士，他都拒绝了，一直在精心著书立说，名声也愈发响亮，

甚至1650年清军入桂被俘后，坚决不降，清慑于他在儒林中的名声，都不敢杀害，只是让他落发为僧后，便将他放走了。

方以智家学渊源，学识博采众长，为人思维开放，主张中西合璧和儒释道三教归一，一生著述400万余言，尚存后世的虽只数十种，但内容广博，文史哲、地理、医药、物理，无所不包。

而郑锦手上的这本《物理小识》，初稿成于1643年，之后流离岭南时又做了几次增改，全书十二卷，涵盖了物理学、医药学、地理学等方面的知识，内容十分的丰富，

郑锦从郭槐那里得到此书后，顿时如获至宝，

《天工开物》大体上比较机械，只是在介绍各种技术，而《物理小识》却更多的是在理论层面去探讨事物，很多都是前无古人的学术贡献，

比如在在地理学方面，他首先便肯定了西方的地圆说，在物理学方面，关于光的色散、反射、折射，关于声音的发生、传播、反射、共鸣，关于比重、关于磁效应等诸多问题的记述与阐述，都极其出色，大体上跟后世物理课堂上讲的已没多大差别。

后世提起中国古代的科技学识，都说是到了明清开始衰落的，

但其实明是明，清是清，需要区分开来，那些科技学识在明朝时不仅没有衰落，反而是达到了一个新的巅峰，

而一到清朝，才顿时从百花开放变为了百花凋零。

这，其实也正是为什么郑锦如此痛恨这个朝代的最大原因！